تتولى الهيئة المهام الرئيسية التالية :-
- الإشراف على أعمال التحريات والتنفيذ لمشاريع السدود والسدات .
- تشغيل وصيانة الأعمال المدنية والميكانيكية والكهربائية لمنشآت السدود والسدات.
- تهيئة مستندات مقاولات الدراسات والتحريات لأعمال السدود والسدات .
- تنظيم خزن وإطلاق المياه بالتنسيق مع المركز الوطني لإدارة المياه بما يؤمن الاستخدام الأمثل للموارد المائية والوقاية من الفيضان وتوليد الطاقة الكهربائية والري وتنمية الثروة السمكية والاستثمار السياحي .
أعمال ونشاطات الهيئة الحالية :
- متابعة تشغيل وصيانة كافة منشات السدود والسدات بأستخدام التقنبات الحديثه
- اعادة تأهيل كافة السدود والسدات التي تعرضت الى تخريب عصابات داعش الارهابيه .
- تنفيذ اعمال التحشيه في سد الموصل والاشراف على دراسات تطوير هذه الاعمال
- متابعة الدراسات والتصاميم للسدود المقترحه وبالتنسيق مع مركز الدراسات والتصاميم الهندسيه
- متابعة اعمال ازالة الترسبات مقدم السدات وازالة الترسبات وتوسيع الحوض الفيضاني (دجلة,الثرثار)
- التنسيق المستمر مع الهياة العامة للمساحة لتنفيذ اعمال الرصد الدقيق للمنشات(السدود والسدات)ضمن اعمال المراقبة الدورية .
- ادامة وصيانة المجمعات السكنية العائدة للسدود والسدات لضمان السكن اللائق لموظفيها
- اعمال التقييم والتأهيل الدوري للسدود المنفذة من خلال اللجان المختصة لضمان سلامتها
- يقوم المختبر التابع للهيئة بإجراء التحاليل الكيميائية لنماذج المياه التي ترد من المشاريع واعداد التقارير الشهرية التي توضح التغييرات الحاصلة من نوعية المياه
- تعزيز الكادر وتطوير المستوى العلمي لعموم الكادر وإشراكهم بدورات تدريبية خارج وداخل العراق لمواكبة التطور العلمي والعملي